半月过后，满清这边调整的差不多了，朱慈烺这边的军队也过来了，高杰的三个团整装待发，在曲阜城当中算是立足了，整个城墙已经被炸得支离破碎，按照朱慈烺的想法，高杰的军队就在城外驻扎，城墙这种东西完全没有必要去修缮，在朱慈烺的版图当中，必须得以热武器来争夺天下，这种东西修起来劳民伤财，根本就没有任何的用处，但实际情况又让朱慈烺不得不修城墙。
当然并不是战争的情况，主要就是附近的流民实在是太多了，如果不想个办法把他们给拴起来的话，恐怕周围的治安情况会一再下降，到时候在地区弄不巧就是千里无人，朱慈烺把这个地区给收回来，可不想这会变成这个样子的，所以朱慈烺才发布了命令，从社会上招纳一批闲散人等，让他们修建曲阜城的城墙，当然待遇也不是很高，只能够让他们吃饱饭而已。
在满清几万溃兵当中，朱慈烺也挑选出来了一万军队，把他们补充到各个军队当中去，李国栋的军队损失尤为庞大，但是朱慈烺并没有让李国栋在这里补充，而是从后方调来了两个预备团，这是从江南征招的士兵，比这边的要忠诚的多，只要是加强训练，李国栋的军队也很快能够恢复战斗力。
在这半个月的时间里，李国栋也把手下的四个团扩编完毕，再加上炮兵团，李国栋手下总共拥有五个团四万六千人，不过这些人朱慈烺不准备留下，而是准备把他们给派回去，接替胡强的防区，也就是原来的江北四镇，让胡强带领军队北上，跟高杰一块镇守曲阜。
虽然李国栋的心里有些不满意，但这件事情也是势在必行的，你手下的军队有一半都是新兵，如果不拉下去好好的训练的话，战场上的子弹可是不长眼的，虽然也可以在曲阜周围进行训练，但如果满清军队马上进攻呢，那个时候你的训练就被打断了。
军队在战场上的战斗力，跟平时的训练有直接关系，这一点李国栋看得清清楚楚，黄得功的军队为何不如咱的呢？就是因为咱的军队底子好，训练的方式方法比较好，所以才有现在的战斗力，就算自己万般无奈，也得按照太子殿下的意思去做，况且不能所有的功劳都给你，人家胡强不用立功吗？
黄得功这个家伙，全身上下也被检查过了，虽然受伤不轻，但并没有伤及要害，朱慈烺也看出来了，这个家伙在战场上也甚是勇猛，对自己也算是忠心，在那种情况下硬是带人亲自冲了上去，对待这样的人，朱慈烺准备了另外一套办法，让黄得功到南京去，在南京组建一个新的步兵旅，在组建步兵旅的期间，黄得功得到叶云的步兵旅去当副旅长，好好的看看人家是怎么训练的，然后再去训练你的军队。
说起现在黄得功手下的军队，三个团两万人马，目前只有五千人归队了，剩下的不是死了就是伤了，基本上没什么希望，所以回去之后跟重建差不多，好歹这五千人也参加过战斗，在战场上见了鲜血的，回去之后也算是有个底子了，比原来全部都是新兵要强的多。
得知朱慈烺的安排之后，黄得功硬是让人把自己抬到了朱慈烺的帐篷前面，虽然没有办法给朱慈烺磕头，但也是给朱慈烺表达了感激之情，这一刻才算是真正的加入了朱慈烺的阵营，如果不打仗的话，这一刻还不知道什么时候到来呢，按照朱慈烺的说法，黄得功这个人能力有限，但忠心还是没有问题的，一个做臣子的能够得到这样的评价，那已经是毕生所求了。
在朝廷当中，能力大小是一个方面，忠心又是另外一个方面，只要是上位者夸你忠心，那就等于是给了你一张长期饭票，只要你日后不图谋造反，不杀人放火，基本上一个富贵繁荣是少不了的。
刘良佐手下还有一百多名士兵被俘虏了，对于这些人，朱慈烺没什么好说的，虽然这些家伙一个劲的说自己被胁迫的，都是刘良佐那个家伙的事情，但朱慈烺也绝不会饶了他们，当时你们在战场上完全可以倒戈一击，但你们并没有这么做，这就说明你们是认同刘良佐的理念的，既然是这样的话，刘良佐都已经去见王爷了，那也应该把你们送下去跟他同行，所以朱慈烺一声令下，一百多人全部在军营旁边被枪毙了。
其他士兵都看到了这一幕，也在他们的心里留下了印象，但他们并没有感觉到这有什么奇怪的，战场上逃跑都是该砍头的，更何况你们这些人反水了，没把你们九族诛尽，这已经是够给面子的了。
也有人给朱慈烺进言，在南京把刘良佐所有的家人都给抓起来，然后诛九族，按照刘良佐所犯的错误，朱慈烺这样做也不会有人说什么，反而会认为是罪有应得，但朱慈烺是一个现代社会来的人，秉承着祸不及家人的原则，仅仅是把刘良佐的家里给抄家了，其他人贬为庶民，以后该怎么样就怎么样，不能因为刘良佐的问题，就把所有的人都给抹杀了。
军队当中还有很多刘良佐的部将，这些人也是惶惶不可终日，对于这些人，朱慈烺也是不能够心慈手软的，军队就是一个拉山头的地方，刘良佐都已经死了，这些人也不可能跟着其他人去混，所以以后他们只能是混日子，与其这样的话，还不如直接把他们给开出去，给足了路费，回家老老实实的去干点其他的吧，省得再次被满清给拉拢了。
这也是有先例的，原来一个人投降了辽东，他的很多手下都会投降，满清看重的就是这些人手里的兵权，朱慈烺把他们送回老家当个农民，手里也就没有了任何的权利，满清人也就看不上他，到时候他们也就没了危险，也算是帮他们的忙了。